Der Islam kam früh nach Äthiopien. Im Jahre 615 flohen Mohammeds Frau und Cousin mit einer Gruppe von Anhängern nach Aksum. Die führenden Kuraysh in Mecca, schickten Leute um sie wieder nach Arabien zu holen, doch Negus Armah, der König von Aksum, weigerte sich, sie herauszugeben und gewährte ihnen Asyl.
Daraufhin befahl der Prophet seinen Anhängern die Äthiopier zu respektieren und zu beschützen. Ein Strom aus Immigranten aus dem Oman und dem Yemen, lies die Zahl der Muslime in Somalia, Eritrea und Äthiopien ansteigen.

In einigen Küstengebieten des heutigen Eritreas sind die meisten Bewohner muslimisch und es gilt islamisches Recht. Ein Nebeneinanderleben mit dem Christentum war nicht immer einfach, und manchmal von offenen Konflikten begleitet. Doch die Sultane waren meist tolerant mit ihren christlichen Mitbürgern und erzwungene Konvertierungen waren selten

1668 gab es in Gonder einen Befehl, dass Christen, Muslime und Juden getrennt voneinander zu leben hätten. Doch jeder konnte in seinem Stadtteil frei seiner Religion nachgehen. Religiöse Unstimmigkeiten gab es immer wieder, doch seit dem 19 Jahrhundert wurden diese im Sinne der Menschen friedlich gelöst.

Politische Konflikte zwischen Äthiopien und Somalia und Eritrea, haben keinen religiösen Hintergrund.

Heute gehören die meisten der ethiopischen Muslime zu den Sunniten, der grössten islamischen Sekte und machen etwa 35% der Bevölkerung aus.